Vi møter først gutten Will, som dreper en mann og må flykte fra vår verden til en parallell verden kalt Citagazze. I det nye universet møter han Lyra. Sammen utforsker de nye verdener og kommer nærmere en løsning på det mystiske stoffet støv, og forholdet til deres respektive fedre. Dette er en historie om å klare seg selv som barn og om kampen mellom autoritet og opprørere, om godt og ondt, om tillit mellom mennesker. Perspektivet skifter mellom Lyra og Will, og deres forståelse av hverandre.