Verdens mest ettersøkte forbryter, Raymond Reddington, bestemmer seg plutselig for å overgi seg og utlevere alle han noen gang har jobbet med til FBI. Han har en mystisk dragning mot FBI-agenten Elizabeth Keen, som han beskytter når listen hans over kriminelle gjør at hun blir satt i stadig farligere situasjoner. I sesong 9 har FBIs spesialstyrke blitt oppløst og Reddingtons oppholdssted er ukjent, men så blir en av deres egne skadet i tjeneste og teamet samles igjen for å avdekke konspirasjonen bak.