Ninjago City trues av den onde krigsherren Garmadon. Den unge Lloyd er en hemmelig ninjakriger. som skjuler seg under aliaset Green Ninja. Sammen med sine tapre ninjavenner under ledelse av den morsomme og kloke lederen Kong Fu Master Wu må han ta opp kampen mot Garmadon. Dessverre for Lloyd er Garmadon tilfeldigvis også hans egen far. Det blir en episk kamp mellom det gode og det onde - og mellom far og sønn.