Handlingen i denne filmen foregår tre år etter at temaparken og luksusresorten Jurassic World ble fullstendig rasert av dinosaurer på rømmen. På Isla Nublar, som er fullstendig forlatt av mennesker, er dinosaurene nå eneherskende. Så begynner øyas sovende vulkan å våkne til liv og truer eksistensen til jordens siste levende dinosaurer. Owen og Clair samler dermed en ekspedisjon for å redde de gjenværende dinosaurene fra utslettelse.