Andalucia, Spania i 1077: Landet trekker til seg kunstnere, forskere og filosofer av alle trosretninger. En varm sommerdag møtes tre gutter, en alkymist, en murer og en prins, tilfeldig under et fikentre. De oppretter et hemmelig brorskap for å bygge et monument som vil imponere og forbause en hel verden. 1938: Den spanske borgerkrigen nærmer seg slutten. En gruppe desperate republikanske soldater holder en tidligere minister og hans barnebarn som gisler i en katedral. De har tenkt å ofre seg selv og alle andre i en meningsløs selvmordsaksjon for å spre død og ødeleggelse. En gammel bok blir oppdaget i et skjult rom under domkirken, en bok som kan bety en fluktrute for å komme seg i sikkerhet.