Forteller og hovedperson i "Fungi" er naturvitenskapsmannen Franz Wilehelm Junghuhn som levde i Berlin og på Java i første halvdel av forrige århundre. Junghuhn møter Schopenhauer i Berlin og går på hans forelesninger.I Schopenhauers tanker om livets meningsløshet finner Junghuhn en slags begrunnelse for sin egen triste tilværelse. Når Franz Wilehlm kommer til Java får han erfare at menneskene der lever i og med, og ikke mot naturen. Filosofen må ta feil. Skjønnhet, kjærlighet, frodig og vill natur er også deler av den guddommelige plan.