Det farlige viruset hundeinfluensa har spredt seg utover millionbyen Megasaki City, og i et desperat forsøk på å få situasjonen under kontroll beordrer borgermester Kobayashi at alle hunder skal deporteres til Trash Island, en øy som også er byens søppelfylling. Dette nekter den korrupte borgermesterens fostersønn, 12-årige Atari, å godta. Da hans elskede vakthund Spots blir deportert drar Atari til Trash Island for å finne ham. Der får han hjelp at flere andre hunder som alle gjør opprør mot den urettferdige behandlingen.