Morten Storm var en ganske usannsynlig jihadist - en høy, rødhåret danske. Som ung var Storm småkriminell og medlem av Bandidos. En bok om profeten Muhammed fikk ham til å konvertere til islam. Han reiste til Jemen og engasjerte seg i Al-Qaida. Etter ett tiår som jihadist begynte han å få betenkeligheter med jihadistenes villighet til å ta uskyldiges liv. Han verver seg så til å bli spion for Vesten - først Danmarks etterretning, deretter CIA og MI-6. Agent Storm tar leseren med på innsiden av jihadistenes verden. Vi kan lese om deres hverdagsliv og planlegging, og vi følger Storm skritt for skritt mens han posisjonerer seg i Al-Qaida for å skaffe seg mest mulig informasjon til sine oppdragsgivere.